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日本公司注册证明文件主要包括以下几项。
1、营业执照：证明公司已经合法注册，并可以开展商业活动。
2、公司章程：规定公司的组织结构、管理方式以及股东和董事的权利和义务等。
3、股东名册：记录公司的股东信息，包括股东姓名、持股比例等。
4、董事名册：记录公司董事的基本信息，如姓名、职务、任期等。
5、印章证明书：证明公司印章的真实性和合法性。
6、公司银行账户证明：证明公司已经在银行开设账户，可以用于接收付款和支付款项等。
7、其他相关证明文件：如税务登记证明、社会保险登记证明等。
需要注意的是，这些文件的具体格式和内容可能因地区和行业而异，因此在注册公司时最好咨询当地的律师或专业服务机构以确保满足所有法律要求和规定，这些文件也需要妥善保管，以备日后查验和维护公司权益时使用。
仅供参考，建议咨询日本当地的律师或专业服务机构，以获取关于日本公司注册证明文件的更准确和全面的信息。